Trong Assassin’s Creed III người chơi sẽ hóa mình vào Connor, người mang 2 dòng máu Anh và thổ dân Mỹ. Chứng kiến cảnh quê hương bị dày xéo, Conner đã trở thành một sát thủ để tiêu diệt kẻ thù và giành độc lập lại cho quê hương của mình.Phần lớn thời gian của game, bạn sẽ phải hoạt động trong những vùng xa xôi, hẻo lánh thay vì những thành phố xa hoa trước kia. Bên cạnh kĩ năng chiến đấu, Connor được ưu ái cho thêm nhiều khả năng mới dựa vào cách di chuyển trong môi trường của mình. Anh có thể trèo cây, chuyền từ cành này sang cành khác một cách nhanh nhẹn và thuần thục. Người chơi được quyền tự do điều khiển nhân vật, không bó buộc trong bất cứ hệ thống chiêu thức nào mà thậm chí còn có thể tự sáng tạo thêm.